El Comite Organizador de los Juegos Centroamericanos San Jose 2013 efectuó el sorteo para el futbol masculino y femenino.
El 6 de marzo se comienza la actividad del futbol femenino en el estadio de Rohrmoser, mientras que el masculino arrancará el 7 de marzo. El fútbol masculino y femenino de este certamen es clasificatorio a los Juegos Centroamericanos y del Caribe en 2014.
Los grupos quedaron así:
FUTBOL MASCULINO
GRUPO I:
COSTA RICA
EL SALVADOR
NICARAGUA
BELICE
GRUPO II:
HONDURAS
GUATEMALA
PANAMA
FUTBOL FEMENINO:
GRUPO I:
COSTA RICA
EL SALVADOR
NICARAGUA
BELICE
GRUPO II:
GUATEMALA
HONDURAS
PANAMA